作为内阁大臣，钱士升可谓是资格最老的，尽管他在内阁的资历比不上内阁首辅周延儒，不过从成为内阁大臣的连续时间上计算，钱士升是占据了优势的。
从当初对东林党人的支持，到后来的融入到东林党人之中，以至于隐隐成为东林党人在朝廷之中的领袖，这个过程并不复杂，况且钱士升并不孤单，随着侯恂进入到内阁，他有了帮手，两人联合起来，能够在内阁之中产生更大的作用。
钱士升见过的事情太多，万历、天启和崇祯年间，党争都是存在的，整个发展的过程，可以说万历年间冒头，天启年间强大，崇祯年间激烈，在这样的熔炉之中铸造，也早就了钱士升热衷于党争的性格。
东林党人遭遇了两个巨大的危机，第一次危机在天启年间，掌握大权的太监魏忠贤仇视和痛恨东林党人，甚至利用手中的权势，宣布东林书院不合法，导致地方官府大规模的清洗东林书院，那一次对东林书院和东林党人的打击是巨大的，但是那个时候，很多的东林党人不顾自身的安危，坚决与以魏忠贤为首的阉党斗争，这样的斗争在读书人中间引发了巨大的震荡，绝大部分的读书人都是倾向于东林书院的，这也导致东林书院和东林党在遭受到沉重打击的同时，以最快的速度崛起。
第二次的危机就是如今了，东林党人最大的对手是太子太保、户部尚书、右都御史、漕运总督郑勋睿。
这一次东林党人遭遇的危机，与天启年间的危机有了很多的不同之处，但有一点是相同的，那就是东林书院同样遭遇到根本上的危机。
郑勋睿是东林党人不同寻常的对手，双反交手的次数不是很多，大部分的时间，都是东林党人主动进攻，郑勋睿处于防御的状态，可是在这样的交手过程之中。东林党人的力量被逐渐的削弱，依附或者是支撑郑勋睿的人越来越多了，这一点在淮北的读书人之中体现的非常明确。
郑勋睿的厉害之处就在于，不在乎与东林党人争一时之长短。而是从根子上进行改变，现如今东林书院在淮北完全绝迹，复社和应社更是无法立足，但郑勋睿做出来这些事情，影响明显不是很大。甚至没有引发太多读书人的关注，因为郑勋睿总是能够在淮北做出其他的事情，引导众人转移目光。
郑勋睿属于暗地里动手，而且每一次动手，都是稳准狠的方式，让东林党人几乎没有还手的余地。
郑家军的强大，让郑勋睿处于不败之地，也让郑勋睿与东林党人之间的斗争，历来都是处于不败之地，总是能够找到最好的时机。给与东林党人致命的打击。
两相比较，郑勋睿才是东林党人真正的对手，当初的魏忠贤，根本不算什么。
这其中的区别，钱士升和侯恂是非常明白的，那就是当年的魏忠贤，采取的是依靠权势一味的打压东林党人，加之魏忠贤是太监的身份，太监治理国家本来就是祸国殃民的趋势，这才会导致众多的读书人反抗。
郑勋睿就不一样了。有着非同一般的学识，可谓是大明科举第一人，而且郑勋睿采用的方式，打压与现实结合。其在陕西和淮安等地做出来的一系列成就，让很多的读书人心服口服，郑勋睿麾下的郑家军，已经成为大明的中流砥柱，如此情况之下，郑勋睿对东林党人动手。就会让那些有着独立思考能力的读书人辩证的对待。
杨廷枢、吴伟业、顾梦麟、史可法等人的转变，就充分说明了这一点。
钱士升和侯恂两人，完全认识到了这一点，在内阁里面，两人穷尽一切的办法，目的就是要打压郑勋睿，让东林党人能够逃过这一劫，让东林党人能够彻底征服郑勋睿。
他们不是没有想过团结郑勋睿，若是能够吸纳郑勋睿，那么东林党人的力量将变得异常强大，可是他们发现这样的想法没有存在的可能性，就从淮北发生的一系列事情来说，郑勋睿与东林党人之间的矛盾就是无法调和的。
东林党人与商贾和士大夫之间的联系是异常紧密的，你中有我我中有你，他们的利益也是联系在一起的，这是东林党人存在的根本，但是郑勋睿从根子上反对这样的做法，出任漕运总督之后，毫不留情的剥夺商贾的利益，要求商贾缴纳保护费，其实这就是要求缴纳商贸赋税，现如今触手慢慢开始触及到士大夫，譬如说淮北农业赋税方面的政策，就出现了略微的调整，官府开始统计士大夫所拥有的耕地，对寻常百姓耕地的赋税也按照实际情况进行调整，只要不是傻子，就应该明白，郑勋睿准备要调整农业赋税了，到时候士大夫和读书人，恐怕也要不同程度的承担农业赋税了。
这样的做法等于是要了东林党人的命，故而他们与郑勋睿之间的矛盾，无法调和。
眼看着郑勋睿的实力愈发的强大，特别是去年打败后金鞑子，更是展现出来强悍的实力，钱士升和侯恂曾经悲观的认为，东林党人最终会拜在郑勋睿的手里。